- · 我院组织专家对“食用作物安全性评价”课题蔬菜子课题进行现场检查[12/02]
- · 科技部科技基础资源调查专项项目总结推进会在我院举行[11/30]
- · 国家水稻产业技术体系长江中游优质常规稻新品种改良岗位研究进展评议会在我院召开[11/30]
- · “柑橘两减”项目召开湖南示范现场观摩考评会[11/24]
- · “耐迟收水稻品种淹水降镉技术示范”现场评议会在永兴县举行[11/20]
- · 国家大宗蔬菜产业技术体系首席专家杜永臣一行来院蔬菜所作学术报告[11/18]
- · 茶叶所召开长期观测实验站建设专家咨询会[11/17]
- · 国家大宗蔬菜产业技术体系2020年度华中片区交流会在我院举行[11/17]
基于全基因组序列和E距离信息的CoxA16病毒亲缘关系分析
作者: 向妍 ; 徐西林 ; 张永生 ; 谭泗桥 ; 李柯 ; 胡晓天 ; 周玮
关键词: CoxA16病毒 全基因组 Kimura2-parameter遗传距离 E距离 进化树
摘要：柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,CoxA16)病毒是引起手足口病(Hand,footandmouthdisease,HFMD)的主要病原体。为了解不同地区CoxA16病毒株的系统进化关系,收集了NCBI数据库中注释有具体地区分布的23条CoxA16全基因组序列,分别采用Kimura2-parameter法和E距离法对病毒株进行亲缘关系分析。结果表明,基于E距离的系统进化树最大程度地吻合了Kimura 2-parameter遗传距离法构建的系统进化树,且E距离法普适性较强,颇具应用潜力,为更精确地判断病毒株之间的进化关系提供了一条新途径。