植物逆境相关基因密码子的偏好性分析

作者: 任燕萍 [1,2] ; 姚正培 [1,2] ; 倪志勇 [1,2] ; 张桦 [1,2]

关键词: 植物逆境相关基因密码子偏好性聚类分析

摘要：运用CodonW1.4.2和SPSS16.0软件对来源于不同植物的17个逆境相关基因的密码子特性进行了分析。结果显示：除CarPRP1基因的ENC值小于40外，其余基因ENC值均介于40～61之间；除CarPRP1基因的GC含量较高外，其余基因的GC含量均在0.35～0.45之间；除CarNAC5基因之外，其他基因密码子第三位碱基的A和T含量远高于C和G含量。这表明：所选逆境相关基因偏爱以A或T结尾的密码子；而且密码子的偏好性与GC含量有关，GC含量越高的基因则密码子使用偏好性越高。聚类分析结果表明：除CarPRP1基因之外，NAC基因家族、CarEP1基因、NHX同源基因、P5CS同源基因、DREB基因相互之间的距离系数相对较小。

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植物逆境相关基因密码子的偏好性分析

作者: 任燕萍 [1,2] ; 姚正培 [1,2] ; 倪志勇 [1,2] ; 张桦 [1,2]

关键词: 植物 逆境相关基因 密码子 偏好性 聚类分析

关键词: 植物逆境相关基因密码子偏好性聚类分析